Dark Sector führt euch in eine alternative Zukunft, in ein Land im sowjetischen Machtbereich. Ihr übernehmt die Kontrolle über den Einzelkämpfer Haydan Tenno in einer von biologischen Waffen verseuchten Welt. Dabei leidet der Protagonist selbst an einer Infektion, die ihm allerdings auch ermöglicht als Mutant neue Kräfte zu verwenden. Als Engine findet die Sector Engine Verwendung, die für die nächste Hardware- und Konsolen-Generation entwickelt wurde.